Gli esseri umani, mosche, vermi ricercatori …

Gli esseri umani, mosche, vermi ricercatori ...

moscerini della frutta e nematodi sono stati a lungo utilizzati come organismi modello per conoscere meglio la biologia umana e le malattie. Ora, i ricercatori della Stanford University School of Medicine hanno scoperto che, sebbene molti aspetti della reti di regolazione sono conservati tra i tre organismi imparentati alla lontana, altre differenze sono emerse nel corso del tempo evolutivo.

Queste differenze possono spiegare il motivo per cui, ad esempio, i vermi strisciano, mosca mosche e gli esseri umani camminano su due gambe, anche se tutti usano gli stessi elementi di genetica di base.

“Stiamo cercando di capire i principi di base che governano come i geni sono accesi e spenti”, ha detto Michael Snyder. PhD, professore e presidente della genetica a Stanford. “Il worm e la mosca sono stati gli organismi modello premier in biologia per decenni, e hanno fornito le basi per gran parte di ciò che abbiamo imparato a conoscere la biologia umana. Se siamo in grado di imparare le regole di espressione genica si sono evoluti nel corso del tempo, siamo in grado di applicare tale conoscenza per capire meglio la biologia umana e le malattie. “

La ricerca è stata condotta come parte di uno sforzo di collaborazione multi-istituzionale per capire di più su come gli organismi controllano l’espressione dei loro geni per generare neuroni, muscoli, pelle, sangue e tutti gli altri tipi di cellule e tessuti necessari per la vita complessa – tutto al momento esattamente a destra e posto nel corpo.

Stiamo cercando di comprendere i principi fondamentali che governano come i geni sono accesi e spenti.

Il nuovo sforzo, noto come modENCODE, porta una simile analisi di organismi modello chiave come la mosca e il verme. Snyder è l’autore maggiore di due dei cinque articoli pubblicati 28 agosto a Natura descrive alcuni aspetti del progetto modENCODE, che ha portato alla pubblicazione, o la pubblicazione imminente, di oltre 20 pubblicazioni in una varietà di riviste.

postdottorato studioso Carlos Araya. PhD, è l’autore principale di uno dei documenti di Stanford, che mappato i siti di legame e modelli di espressione cellulari di 92 fattori di regolazione in ascaridi laboratorio C. elegans. postdottorato studioso Alan Boyle, PhD, azioni portano paternità con Araya sulla seconda carta, che confronta i dati ascaridi appena generato con umana e mosca della frutta fattori regolatori per identificare le regioni di similarità e differenze tra gli organismi. Ricercatore associato Trupti Kawli, PhD, ha coordinato le ricerche in laboratorio Snyder ed è co-autore di entrambi i documenti.

Di mosche, vermi e gli esseri umani

“Per la prima volta siamo ora in grado di seguire in dettaglio dove e quando particolari regioni del genoma sono usati per regolare l’espressione genica, e siamo in grado di mappare le cellule in cui operano con un livello di precisione senza precedenti”, ha detto Snyder , che è anche la Stanford W. Ascherman, MD, FACS, Professore di Genetica.

I giocatori di proteine ​​esatte e sequenze di DNA coinvolti nel legame o servire come i punti caldi anche spesso differivano tra umano, volare e vite senza fine – forse riflettendo differenti pressioni evolutive. Tali differenze sono una ragione probabile per cui mosche, vermi e gli esseri umani sono così distinte per forma, dimensioni, e il comportamento per esempio.

Ad alimentare la ricerca futura

La ricchezza dei dati del progetto modENCODE alimenterà progetti di ricerca per decenni a venire, secondo Snyder.

“Ora abbiamo una delle immagini più complete mai generate delle regioni regolatorie e dei fattori in diversi genomi”, ha detto Snyder. “Questa conoscenza sarà preziosa per i ricercatori nel campo.”

Ulteriori autori Stanford sono studiosi post-dottorato Dan Xie. PhD, e Yong Cheng. PhD; assistenti di ricerca Lixia Jiang e Pechino Wu; ex socio di ricerca Cathleen Brdlik, PhD; sviluppatore di software Philip Cayting; e assistente professore di genetica e di informatica Anshul Kundaje. PhD.

Informazioni su Department della Stanford di Genetica, che ha sostenuto anche il lavoro, è disponibile all’indirizzo http://genetics.stanford.edu.

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